Computer-aided diagnosis tool for cervical cancer screening with weakly supervised localization and detection of abnormalities using adaptable and explainable classifier

While pap test is the most common diagnosis methods for cervical cancer, their results are highly dependent on the ability of the cytotechnicians to detect abnormal cells on the smears using brightfield microscopy. In this paper, we propose an explainable region classifier in whole slide images that could be used by cyto-pathologists to handle efficiently these big images (100,000x100,000 pixels). We create a dataset that simulates pap smears regions and uses a loss, we call classification under regression constraint, to train an efficient region classifier (about 66.8% accuracy on severity classification, 95.2% accuracy on normal/abnormal classification and 0.870 KAPPA score). We explain how we benefit from this loss to obtain a model focused on sensitivity and, then, we show that it can be used to perform weakly supervised localization (accuracy of 80.4%) of the cell that is mostly responsible for the malignancy of regions of whole slide images. We extend our method to perform a more general detection of abnormal cells (66.1% accuracy) and ensure that at least one abnormal cell will be detected if malignancy is present. Finally, we experiment our solution on a small real clinical slide dataset, highlighting the relevance of our proposed solution, adapting it to be as easily integrated in a pathology laboratory workflow as possible, and extending it to make a slide-level prediction.     

小分子抗血管生成药物在非小细胞肺癌中的研究进展

肺癌是世界上发病率最高的癌症之一，且尚无二线进展后的标准治疗方案，而肿瘤血管生成目前已被确定为恶性肿瘤的重要治疗靶点，小分子多靶点血管激酶抑制剂可通过抑制血管生成相关信号通路，抑制肿瘤血管的生成。目前已开展多项小分子抗血管生成药物治疗非小细胞肺癌的临床试验，且已有部分血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（vascular endothelial growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors, VEGFR-TKIs）获批治疗晚期非小细胞肺癌，本文基于国内外多项小分子抗血管生成药物治疗非小细胞肺癌的发展现状，归纳了多个VEGFR-TKIs及成纤维细胞生长因子受体（fibroblast growth factor receptor, FGFR）-TKI单药或联合[包括分别与化疗、表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR）-TKIs、免疫治疗、放疗等联合）]治疗非小细胞肺癌的疗效与安全性研究，同时探讨了VEGFR-TKIs可能存在的耐药机制及疗效预测指标等，并对未来抗血管治疗非小细胞肺癌的发展趋势以及存在的潜在问题进行展望，同时为肺癌后续的精准治疗及个体化治疗提供新的思路。     

CCK-8上调小鼠腹腔巨噬细胞B7.1和B7.2表达并增强其协同刺激活性

目的： 探讨八肽胆囊收缩素（CCK-8）对静息巨噬细胞B7.1和B7.2表达及其协同刺激功能的影响。方法：用CCK-8（10-12-10-6 mol/L）孵育小鼠腹腔巨噬细胞一定时间，采用流式细胞术分析细胞表面B7.1和B7.2含量的变化。用免疫磁珠从小鼠脾细胞分离CD4+T细胞，按4∶〖KG-*2〗1数量比与腹腔巨噬细胞（预先用CCK-8和/或抗B7.1抗体、抗B7.2抗体、CCK1R拮抗剂CR1409、CCK2R拮抗剂CR2945孵育24 h）共同体外培养，同时加入ConA 5 mg/L，采用［3H］掺入法测定CD4+T细胞增殖反映巨噬细胞的协同刺激活性。结果：CCK-8可上调静息巨噬细胞B7.1及B7.2的表达，并增强巨噬细胞的协同刺激活性。CCK-8的作用呈剂量依赖性，最大效应剂量是在10-9-10-7 mol/L之间。抗B7.2抗体可减轻CCK-8增强巨噬细胞协同刺激活性的作用，CR1409及CR2945均能逆转CCK-8的上述作用，且CR1409的作用较CR2945更明显。结论：CCK-8通过上调巨噬细胞B7.2表达而增强其协同刺激活性，该作用由CCK1R及CCK2R介导，其中CCK1R起主要介导作用。     

非受体型酪氨酸激酶-Syk蛋白的提取与纯化

目的 :从转染syk基因的Sf2 1细胞中提取、纯化免疫相关因子Syk蛋白。方法 :将syk基因转染Sf2 1细胞 ,于 2 8℃培养 48h ,收集细胞 ,用超声波破碎仪裂解细胞 ,提取裂解液中总蛋白 ,用Yellow 3凝胶和Toyopearl AF Heptin 650M凝胶层析柱分离、纯化。层析液中的Syk蛋白存在和性质 ,用SDS PAGE、免疫印迹实验和等电聚焦实验鉴定。结果 :从 2 5亿个Sf2 1细胞裂解液中提取了含有Syk的 2 2 5mg蛋白质。经Yellow 3凝胶层析分离 ,得到两个亚种的Syk蛋白 ,相对分子质量 (Mr)均为72× 10 3 。进一步用Toyopearl AF Heptin 650M凝胶层析纯化后 ,得到两个纯的Syk蛋白 ,SDS PAGE、免疫印迹实验结果显示 ,两种Syk的Mr 均为 72× 10 3,与Syk的理论相对分子质量吻合。但等电聚焦实验显示 ,这两种Syk蛋白成分具有不同的pI值。结论 :从 2 5亿个转染syk基因的Sf2 1细胞中纯化出8mgSyk蛋白 ,纯度高于 95%。这两种Syk的Mr 虽然相同 ,但具有不同的pI值 ,是两个亚种。这些Syk可用于研究Syk的作用机制、抗Syk抗体的制备和Syk诊断试剂盒的制备等     

精-甘-天冬-丝氨酸4肽对肝星状细胞增殖及凋亡的影响

目的: 探讨精-甘-天冬-丝氨酸(RGDS) 4肽对纤维连接蛋白(FN)刺激的肝星状细胞(HSCs)增殖、凋亡及caspase-3表达的影响。方法: 应用体外HSCs培养技术, 采用[³H]-胸腺嘧啶核苷([³H]-TdR)掺入法测定HSCs增殖;膜联蛋白(Annexin-V)/碘化丙啶(PI)双标记流式细胞术、TUNEL、扫描电镜及透射电镜等方法测定HSCs凋亡;采用甲苯胺兰染色方法测定细胞粘附率;应用流式细胞方法测定caspase-3蛋白表达。结果: ①25 mg·L^-1、50mg·L^-1、100mg·L^-1浓度RGDS 4肽剂量、时间依赖性抑制HSCs增殖, P＜0.01。②RGDS 4肽对HSCs凋亡的诱导作用亦呈剂量和时间依赖关系, P＜0.01。扫描电镜、透射电镜观察, RGDS 4肽组出现典型的凋亡征象。③RGDS 4肽作用于HSCs 2 h, 25 mg·L^-1、50mg·L^-1、100mg·L^-1组粘附抑制率分别是8.82%、29.41%、45.59%, 而RGES 4肽组的粘附抑制率仅为4.41%, P＜0.01。④RGDS 4肽处理组caspase-3表达明显高于FN、RGES 4肽组。结论: RGDS 4肽剂量和时间依赖性抑制HSCs增殖并诱导其凋亡。RGDS 4肽抑制增殖及诱导凋亡效应, 依赖于caspase-3, 也与其抗粘附作用有关。     

卵巢癌细胞DNA倍体、p21及p53基因表达产物定量分析

目的　探讨卵巢癌DNA倍体、p2 1及 p5 3基因定量表达情况及其临床意义。 方法　应用流式细胞术 (FCM )和荧光免疫技术 ,对 3 9例卵巢癌组织的卵巢癌细胞和 9例正常卵巢组织的卵巢细胞的染色体倍体、p2 1基因和 p5 3基因表达产物进行定量分析。结果　在卵巢癌组织中DNA的异倍体率、p2 1、p5 3基因蛋白产物的阳性表达率均明显高于对照组 ,两者比较均有非常显著性差异 (P <0 .0 1)。结论　应用FCM定量测定卵巢癌细胞中的DNA倍体、p2 1及 p5 3基因表达产物 ,在临床上具有重要的参考价值     

VEGF反义RNA对人食管癌细胞抑制作用的研究

目的: 研究血管内皮生长因子(VEGF)反义RNA对人食管癌细胞的抑制作用,探讨以VEGF反义RNA进行食管癌基因治疗的可行性.方法: 采用脂质体法将反义VEGFcDNA质粒转染入食管癌细胞TE-1;用MTT法检测细胞增殖情况;用免疫组化法检测VEGF蛋白表达;原位杂交和RT-PCR技术检测VEGFmRNA的表达.流式细胞术检测细胞的凋亡率和周期分布.结果: 被反义VEGFcDNA质粒转染的食管癌细胞有外源性VEGF反义基因的整合及表达,该细胞的VEGFmRNA及蛋白表达水平降低,但细胞生长速率无明显改变,未发生明显凋亡现象;接种裸鼠后,形成肿瘤的时间明显延长,肿瘤的体积和重量明显减小.结论: VEGF反义RNA可抑制食管癌细胞VEGF表达和裸鼠体内的肿瘤生长.该表达体系为食管癌基因治疗的进一步研究奠定了基础.     

五加皮Age蛋白在正常小鼠与荷瘤小鼠体内的组织分布

目的探讨五加皮抗肿瘤成分A ge蛋白在正常小鼠与荷瘤小鼠体内的组织分布。方法用氯胺T法对A ge蛋白进行125I标记(形成125I-A ge),由尾iv小鼠后,于不同时间取组织和血液标本,测定放射cpm比值。以放射参与量(即脏器与血液中cpm比值)作为125I-A ge在组织中分布的依据。结果在一次性快速iv125I-A ge 2 h后,正常小鼠和荷瘤小鼠体内均以肾脏中125I-A ge的分布量最高,肝脏和肺部放射参与量也较高,与心脏、脾脏等其他脏器相比差异有显著性(P<0.01);尿中125I-A ge的量很高。iv同等剂量125I-A ge后,荷瘤小鼠的肾脏、肝脏和肺部组织的放射参与量比正常小鼠偏高(P<0.05)。结论五加皮A ge蛋白在小鼠体内主要分布于血流丰富的组织,主要通过泌尿系统排泄,不易透过血脑屏障。